一、黨政機構: 黨政辦公室、組織人事部(宣傳統戰部)、紀委、學生處(招生就業處)、教務處、總務處、財務處、保衛處(武裝部)
二、教學單位: 工程科技學院、醫學護理學院、生化工程系、建筑工程系、經濟貿易系、人文教育學院、思政教學部(基礎教學部)、中專部(阜陽衛校)
三、教輔單位: 圖文信息中心、實驗實訓中心(培訓中心)
四、群團組織: 工會、團委